Ganzgenomsequenzierung in der Hygiene – sinnvoller Einsatz: Chancen und Grenzen
Maechler, F. · Krankenhaushygiene up2date · 2024 · Heft 3 · S. 225 bis 242
Bibliografische Angaben
Zusammenfassung
Hygieneteams werden im Krankenhaus oft mit der Frage konfrontiert, ob es sich bei Erregern mit pathogenem Potenzial oder auffälligem Resistenzmuster, die in zeitlichem und räumlichem Zusammenhang bei mehr als einem Patienten nachgewiesen werden, um die „gleichen“ Erreger handelt. Im Kern geht es also um die Frage der Erregerübertragung. Die Ganzgenomsequenzierung (WGS) ermöglicht hochauflösende Analysen genetischer Materialien von Bakterien und hilft, genetische Verwandtschaften und Übertragungswege zu identifizieren. Lange Zeit stand bei der Hochdurchsatzsequenzierung die Short-Read-Sequenzierung im Vordergrund…