Systembiologisch Netzwerkanalyse der Gen-Interaktion in der hepatozellulären Karzinogenese
J Bornschein, I Drozdov, T Wex, N Valeyev, S Tsoka, P Malfertheiner · Zeitschrift für Gastroenterologie · 2011 · Heft 08
Bibliografische Angaben
Zusammenfassung
Hintergrund: Die Pathogenese des hepatozellulären Karzinoms (HCC) ist komplex. Neue Methoden der bioinformatischen Interferenzanalyse von Genexpression und ihre Organisation in regulatorischen Netzwerken erlauben, die Interaktion verschiedener Signalkaskaden im Krankheitsprozess aufzudecken. Methoden: Die Netzwerke zellulärer Signalkaskaden wurden über einen mathematischen Algorithmus revers konstruiert. Dabei wurden etwa 6 Millionen Gen-Gen-Interaktionen aus 709 öffentlich zugänglichen humanen Genom-weiten mRNA-Datensätzen berücksichtigt. Die Datensätze wurden aus gewebebasierten Analysen gewonnen, die an gesun…